В журнале публикуются статьи по терапии, гастроэнтерологии, кардиологии, пульмонологии, нефрологии и другим терапевтическим дисциплинам, неврологии, фармакологии и др. В Крымском терапевтическом журнале также находят отражение руководящие документы Министерств здравоохранения Республики Крым и Российской Федерации. Отдельное место занимает раздел «В помощь семейному врачу», освещающий важнейшие вопросы семейной медицины, где публикуются также статьи в помощь семейному врачу по терапии и смежным дисциплинам, хирургии, неврологии и других. Ряд публикаций в разделе «Оригинальные исследования» имеют отечественный или мировой приоритет.